Vào tháng 11 năm 2006, tờ The Los Angeles Daily News đã viết thông báo rằng bạn đời của Allen, Jeremy Glazer, cũng tham gia bộ phim Save Me.[21] Trong một cuộc phỏng vấn vào tháng 9 năm 2008 với Out.com, Allen nói rằng anh hiện đang ở trong một mối quan hệ ba năm và đã tỉnh táo trong tám năm.[11] Vào tháng 10 năm 2008, AfterElton.com tuyên bố bạn trai của mình là Glazer.[22] Vào tháng 5 năm 2009, Allen đã nhận được Giải thưởng Truyền thông GLAAD: Giải thưởng Davidson/Valentini. Trong bài phát biểu nhận giải, anh nói rằng anh đã gặp Glazer, bạn đời của mình, đúng bốn năm trước đó.[23] Họ chia tay vào năm 2015.

Vào tháng 4 năm 2015, Allen tuyên bố từ giã nghiệp diễn trong một video, nói rằng anh có kế hoạch trở thành một nhà tâm lý học lâm sàng. "Đó là một hành trình thú vị...làm việc trên các chương trình mà tôi đã phải làm trong nhiều năm. Tôi vô cùng biết ơn ngày hôm nay, tôi đã và sẽ luôn như vậy", thêm, "Cuộc sống của tôi đã đưa tôi đến một quỹ đạo rất khác và sau hơn 30 năm làm diễn viên, cách đây vài năm, tôi đã quyết định bắt đầu để phần đó của cuộc đời mình đi và tôi đang tập trung vào việc học của mình."[4]

Allen tốt nghiệp Đại học California, Los Angeles vào tháng 6 năm 2015 với bằng Cử nhân Nghệ thuật Tâm lý học.[24] Anh ấy được ghi danh với tên thật là Chad Allen Lazzari với tư cách là nghiên cứu sinh Tiến sĩ Tâm lý học tại Đại học Antioch New England.[25]